日本全国に分布し川の下流から上流の渓流、池や沼湖に生息し、沿岸地域にも見られる場所もあります。産卵期は春で、婚姻色は腹部が紅色に染まり、体に黒色のラインが鮮明になり、急流の川底に産卵します。大阪府では絶滅し残念ながらウグイの姿を見る事が、できなくなってしまいました。